Πληροφορούμενη την απώλεια του Νίκου Εμμ. Παπαδάκη, η υπουργός Πολιτισμού Λίνα Μενδώνη τον χαρακτήρησε «ψυχή» του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών και Μελετών «Ελευθέριος Βενιζέλος» εκφράζοντας τα συλλυπητήριά της στην οικογένειά του, ενώ η τέως Πρόεδρος της Δημοκρατίας Κατερίνα Σακελλαροπούλου τον χαρακτήρισε «πρωτεργάτη».
«Με πολύ μεγάλη θλίψη πληροφορήθηκα την απώλεια του Νίκου Εμμ. Παπαδάκη, του προσφιλούς μας Παπαδή. Διευθυντής και ψυχή, για πάνω από είκοσι χρόνια, του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών και Μελετών «Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος», συνέβαλε, όσο ελάχιστοι, στη μελέτη του έργου και της προσωπικότητας του Βενιζέλου, αλλά και της εποχής του. Από τη θέση του στο Ίδρυμα διέσωσε και κατέστησε προσιτό πολύτιμο αρχειακό υλικό, διοργάνωσε δεκάδες συνέδρια, συντόνισε και στήριξε ερευνητικές δράσεις, δημοσίευσε δεκάδες εκδόσεις υψηλότατου επιστημονικού επιπέδου. Με την ογκώδη και εξαντλητική βιογραφία του Ελευθέριου Βενιζέλου, ένα πραγματικό έργο ζωής, κατέλιπε ένα βιβλίο αναφοράς για το πρόσωπο και την εποχή του Εθνάρχη», δήλωσε η υπουργό Πολιτισμού Λίνα Μενδώνη.
«Είχα την τύχη να έχω μαζί του πολυετή γνωριμία και συνεργασία. Να εκτιμήσω το ασίγαστο πάθος του για όλο και περισσότερα εγχειρήματα, που μετατρέπονταν υποδειγματικά σε πράξη, το υψηλό αίσθημα ευθύνης του έναντι του πολίτη, την άκρατη πίστη του στις φιλελεύθερες ιδέες, προσαρμοσμένες στη σύγχρονη πραγματικότητα. Ο Νίκος Εμμ. Παπαδάκης υπήρξε ένας επίλεκτος πολίτης και ένας αφοσιωμένος φίλος. Στην οικογένειά του, τους πολυάριθμος φίλους και τους συνεργάτες απευθύνω ειλικρινέστατα συλλυπητήρια», πρόσθεσε.
Με τη σειρά της η τέως Πρόεδρος της Δημοκρατίας Κατερίνα Σακελλαροπούλου, αναφέρει: «Ο Νίκος Παπαδάκης αφιέρωσε τη ζωή του στη μελέτη και την ανάδειξη του έργου του Ελευθερίου Βενιζέλου. Πρωτεργάτης και Γενικός Διευθυντής του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών και Μελετών “Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος”, υπηρέτησε τους σκοπούς του για 25 χρόνια με πάθος και αφοσίωση. Με την καθοδήγησή του, το Ίδρυμα αναδείχθηκε στον σημαντικότερο φορέα έρευνας, εκπαίδευσης και διάδοσης της ιστορικής μνήμης και της πολιτικής παρακαταθήκης του κορυφαίου αυτού Έλληνα πολιτικού».
Η κ. Σακελλαροπούλου τόνισε τη συμβολή του Ν. Παπαδάκη στην ανάδειξη της σχέσης του Βενιζέλου με το ΣτΕ λέγοντας: «Ιδιαίτερη μνεία αξίζει στη συμβολή του στην ανάδειξη της σχέσης του Βενιζέλου με το Συμβούλιο της Επικρατείας. Πολιτικός που συνδέεται άρρηκτα με το ΣτΕ, αφού χάρις στο δικό του όραμα και επιμονή ιδρύθηκε το Δικαστήριο το 1929 ως θεσμικό αντίβαρο στην ως τότε παντοδύναμη εκτελεστική εξουσία, θεσμική τομή που χαρακτηρίσθηκε, όχι άδικα, ως “μία εκ των θαυμασιωτέρων προόδων του νεωτέρου Κράτους”».
Στη συνέχεια αναφέρθηκε στη γνωριμία της με τον Νίκο Παπαδάκη όταν επισκέφθηκε το Ίδρυμα ως Πρόεδρος του Συμβουλίου της Επικρατείας τον Οκτώβριο του 2019. «Εκεί θέσαμε τις βάσεις για τη διοργάνωση ενός κοινού συνεδρίου του Ιδρύματος με το ΣτΕ, στο οποίο θα αναδεικνυόταν η συμβολή του Ελευθερίου Βενιζέλου στην ίδρυση του Δικαστηρίου. Το συνέδριο αυτό, με τίτλο “Εννέα δεκαετίες Συμβούλιο της Επικρατείας. Οι οραματισμοί του Ελευθερίου Βενιζέλου και η εξέλιξη του θεσμού στη διαδρομή του χρόνου”, πραγματοποιήθηκε τον Ιούνιο του 2021 στο ΣτΕ, με μεγάλη επιτυχία».
Η Τέως Πρόεδρος της Δημοκρατίας κλείνει το μήνυμά της λέγοντας: «Μέσα από τη συνεργασία και τη φιλία με τον Νίκο Παπαδάκη είχα την ευκαιρία να διαπιστώσω την αγάπη του για την Κρήτη και τον Ελευθέριο Βενιζέλο, την αφοσίωσή του στους σκοπούς του Ιδρύματος, και την εμβρίθεια του συγγραφικού του έργου, στο οποίο ξεχωριστή θέση κατέχει η βιογραφία του Εθνάρχη.
Εκφράζω τη βαθιά μου θλίψη για τον θάνατό του και τα θερμά μου συλλυπητήρια στους οικείους του. Τον αποχαιρετώ όμως με τη βεβαιότητα ότι το έργο του θα συνεχίσει να φωτίζει τις νέες γενιές ερευνητών και ότι το Ίδρυμα θα προχωρήσει με σιγουριά, πάνω στα γερά θεμέλια που εκείνος έθεσε».