Και δεύτερος σεισμός σημειώθηκε στη Σάμο το μεσημέρι της Τετάρτης, μετά από τα 4,7 Ρίχτερ. Μόλις 14 λεπτά αργότερα, σημειώθηκε και δεύτερη δόνηση, 5 βαθμών της κλίμακας Ρίχτερ.
Σύμφωνα με την αυτόματη λύση του Γεωδυναμικού Ινστιτούτου, το επίκεντρο της δεύτερης δόνησης εντοπίζεται 14χλμ βορειοδυτικά του Αγαθονησίου -πολύ κοντά στο σημείο που έδωσε τον πρώτο σεισμό.
Το εστιακό βάθος υπολογίζεται σε 10χμλ.
